Nacido y muerto en Calatayud (Zaragoza). Cursó humanidades, música y, más tarde leyes en la Universidad de Salamanca. Limosnero de la Seo de Zaragoza (1575) y sacerdote (1579). Fue el principal promotor de la fundación del colegio de la Compañía de Jesús en Calatayud (1584). Fui oidor en el Consejo de Órdenes y consejero en el de Indias (1590). Vivió bajo la protección de su tío Antonio Agustín, obispo de Lérida y autor del libro en el que aparece su exlibris. Como su tío, aficionado a los estudios de arqueología y numismática.
Es autor de varios tratados jurídicos y unas historias inéditas de la familia Zapata.
Latassa y Ortín, Félix de, Bibliotecas antigua y nueva de escritores aragoneses de Latassa, aumentadas y refundidas en forma de diccionario bibliográfico-biográfico, por Miguel Gómez Uriel, Zaragoza: C. Ariño, 1884-1886, III, págs. 412-414.
Juan Francisco Baltar Rodríguez, «Zapata y Palafox, Rodrigo», en Diccionario biográfico español, Madrid: Real Academia de la Historia, 2009-2013, L, págs. 735-737.
Exlibris manuscrito Zapata y Palafox, Rodrigo
