Nacido en Málaga y muerto en Córdoba. Estudió derecho canónico en la Universidad de Osuna (Sevilla). Desempeñó varios cargos eclesiásticos (racionero, canónigo, juez eclesiástico...) en las diócesis de Córdoba, Sevilla y Granada.
Mantuvo contacto con literatos y eruditos como Francisco Fernández de Córdoba, Luis de Góngora, Tomás Tamayo de Vargas, etc.
Es autor de Del origen y principio de la lengua catellana (1606), considerada como la primera gramática histórica del castellano. Escribió además otras obras de carácter histórico.
Helena Gimeno Pascual, «Aldrete Passadas, Bernardo José de», en Diccionario biográfico español, Madrid: Real Academia de la Historia, 2009-2013, III, págs. 529-530.
Pablo Jauralde Pou (dir. del proyecto), Biblioteca de autógrafos españoles, II (Siglos XVI-XVII), al cuidado general de Carolina Fernández Cordero, Madrid: Calambur, 2011, págs. 20-22.